ISSN 1866-8836
Клеточная терапия и трансплантация

Сравнительный анализ частот пятилокусных HLA гаплотипов у доноров двух Российских регистров

Елена В. Кузьмич1, Ольга А. Макаренко1, Михаил Н. Вавилов2, Елена И. Шагимарданова3, Раушания Ф. Гайфуллина3, Анна В. Андрюшкина1

1 Национальный регистр доноров костного мозга имени Васи Перевощикова, Москва, Россия
2 Челябинский государственный университет, Челябинск, Россия
3 Институт фундаментальной медицины и биологии, Казанский Федеральный университет, Казань, Россия

Резюме

Развитие сети российских донорских регистров является важной задачей, нацеленной на повышение эффективности поиска неродственного донора для Российских пациентов. Привлечение волонтеров должно способствовать не только увеличению численности потенциальных доноров, но и расширению пула HLA гаплотипов, представленных в базах данных Российских регистров. Цель исследования – сравнение распределения пяти-локусных HLA гаплотипов, определенных на основе данных HLA типирования высокого разрешения, у потенциальных доноров из двух российских регистров.

Методы

Когорта Национального регистра доноров костного мозга имени Васи Перевощикова (Национальный РДКМ) включала 1563 донора. HLA типирование выполнено с помощью секвенирования нового поколения (NGS). Анализ данных осуществлен с помощью программы Arlequin version 3.5. Для сравнительного анализа использовались данные, опубликованные Регистром доноров костного мозга Первого Санкт-Петербургского Государственного Медицинского Университета им. акад. И. П. Павлова (Регистр ПСПбГМУ им. И. П. Павлова) [1]. В данном исследовании представлены результаты HLA типирования методом моноаллельного секвенирования по Сэнгеру 1000 доноров.

Результаты

В обследованной группе доноров Национального РДКМ определены 1439 гаплотипов. В когорте доноров Регистра ПСПбГМУ им. И. П. Павлова – 1352 гаплотипа. С максимальной частотой в группах сравнения определяется гаплотип A*01:01:01-B*08:01:01-C*07:01:01-DRB1*03:01:01-DQB1*02:01:01 (Табл. 1). Этот гаплотип является наиболее распространенным у представителей большинства Европейских популяций (http://www.allelefrequencies.net). Гаплотип A*02:01:01-B*13:02:01-C*06:02:01-DRB1*07:01:01-DQB1*02:02:01 более распространен в когорте доноров Национального РДКМ (2,66% против 1,01%, p=0,00005). Выявлена тенденция более высокой частоты гаплотипа A*03:01:01-B*07:02:01-C*07:02:01-DRB1*15:01:01-DQB1*06:02:01 у доноров Регистра ПСПбГМУ им. И. П. Павлова (3,12% против 2,43%, p=0,15). Гаплотип A*30:01:01-B*13:02:01-C*06:02:01-DRB1*07:01:01-DQB1*02:02:01 принадлежит к часто встречающимся у доноров Национального РДКМ, но входит в число наиболее распространенных гаплотипов в Регистре ПСПбГМУ им. И. П. Павлова.

Заключение

Несмотря на то, что представленные регистры привлекают волонтеров из регионов Российской Федерации, отмечаются некоторые различия в распределении и частотах пяти-локусных HLA гаплотипов. Работа всех регистров Российской Федерации позволит увеличить пул HLA гаплотипов, представленных в Российских поисковых системах и, тем самым, повысить эффективность поиска неродственного донора для Российских пациентов.

Ссылка

Е. В. Кузьмич, А. Л. Алянский, В. В. Ермолина и сотр. Опыт применения метода секвенирования для иммуногенетического обследования потенциальных доноров в регистре доноров костного мозга ПСПбГМУ им. И. П. Павлова. Трансфузиология. 2018; 19 (4):49-58.

Ключевые слова

Донор костного мозга, регистр, HLA гаплотип, частота.


Том 8, Номер 3
30.09.2019

Загрузить версию в PDF

Возврат к списку