ISSN 1866-8836
Клеточная терапия и трансплантация

Diva-Fit: поэтапное руководство к построению графиков и гистограмм с высоким разрешением для анализа данных проточной цитометрии, полученных посредством пакета программ FACSDiva

Вебер К., Фезе Б.

doi 10.3205/ctt-2009-en-000045.01
Отправлено 26 Мая 2009
Одобрено 03 Июля 2009
Опубликовано 04 Августа 2009

Резюме

За последние годы произошла революция в области проточной цитометрии, в связи с внедрением компьютерной обработки данных и средств анализа, что облегчает одновременное изучение десяти и более параметров. В то же время некоторые средства, представления данных, предлагаемые коммерческими поставщиками, остались удивительно „старомодными“. Это приводит к странной ситуации, в которой высококачественные данные часто представлены низкокачественными иллюстрациями, а именно в виде точечных (пиксельных) построений. В особенности, данные, полученные с применением программного продукта FACSDiva часто отображаются рисунками в виде низкоразрешающей пиксельной графики, что приводит к изображениям плохого качества. К тому же, даже новейшая версия, Diva_6.1.2, все еще неспособна совместить две или несколько гистограмм в одну картину ("наложенная гистограмма") – популярное и убедительное средство прямого сравнения данных. В связи с этим, мы предлагаем легкий и практичный набор программных средств (Diva-Fit) для улучшения рисунков, продуцируемых с помощью программы Diva, которая облегчает создание высокоразрешающих графиков на основании данных, полученных посредством пакета FACSDiva. Кроме того, Diva-Fit дает возможность легкого удаления нежелательных квадрантных меток без ухудшения качества рисунков по данным проточной цитометрии.       

Наконец, мы показываем, что Diva-Fit поддерживает функцию построения наложенных гистограмм. Для работы с Diva-Fit необходимы следующие программные продукты: BD-FACSDiva 6.1.2; (2) PDF Creator 0.95; (3) Adobe Acrobat Reader, версия 9.1.0.  или более новая; (4) GIMP 2.6.4. для создания наложений для гистограмм; (5) Inscape 0.46 для удаления излишнего текста внутри рисунков. Отмечается относительная сложность работы с (4) и (5).  Важно отметить что все программные средства необходимы для Diva-Fit доступны бесплатно. Мы считаем, что предлагаемый набор программных средств может быть очень полезным для многих исследователей, работающих в области проточной цитометрии.

Ключевые слова

проточная цитометрия, анализ данных, графическое отображение, высокоразрешающие изображения, наложенные гистограммы, бесплатные программы


Том 1, Номер 4
01.03.2010

Загрузить версию в PDF

doi 10.3205/ctt-2009-en-000045.01
Отправлено 26 Мая 2009
Одобрено 03 Июля 2009
Опубликовано 04 Августа 2009

Возврат к списку